患者通常在感染后的第一到第二周出现病症，其临床过程可分为三个阶段。
一、早期阶段
此阶段持续约二至四天，患者会出现发热、全身乏力、头痛等症状，同时伴随着腓肠肌压痛、眼结合膜充血以及浅淋巴结肿大等中毒表现。
二、中期阶段（钩体血症极端期）
在病后的第四到十天，患者会表现出明显的脑膜炎症状，如剧烈头痛、频繁呕吐以及颈椎强直等。部分特殊病例甚至可见脑或脑干受到侵犯，于脑脊液中可检测到钩端螺旋体的存在。
三、后期阶段（后发症期或恢复期）
大多数患者在这个阶段会逐渐恢复正常，部分患者会出现两种类型的神经并发症。
首先是脑膜炎的后发类型：这种类型主要为急性期的失常症状，表现为脑膜受到刺激，淋巴细胞和卵白增高，可在宠物犬身上检测到钩端螺旋体抗体。
其次是钩体脑动脉炎：这种病状由急性期退烧后发展而来，病期可能持续半至五个月。主要症状表现为神经紧张合并症，进一步演变为高发性脑动脉炎。由于内膜增厚和血管闭塞，容易引起脑梗死。宠物犬可能表现出中枢性面舌瘫坏，部分犬可能出现半身不遂或单瘫，丧失运动能力。在严重的情况下，可能出现全身或局部癫痫，甚至持续癫痫发作。患犬在主干动脉闭塞后形成的侧支循环，会逐渐形成异常的脑底血管网，类似烟雾病等病症。
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